人征服后，蒙古朝廷对佛教的日渐尊崇使少林寺免受了军队的洗劫，甚至还一度得到蒙古王公的宠幸。1268年，少林寺心禅堂的高僧福裕在蒙哥汗的御前比武大会上挫败全真教的掌教张志敬，依靠蒙古政府的支持收回了被全真教侵占的权益，也令全真教盛况不再。135

但不久后，汉传佛教在蒙古人中的优势地位就被更加富有吸引力的藏传佛教、伊斯兰教甚至基督教所压倒。金轮仁波切和八思巴等人受到的尊崇令少林高僧望尘莫及。在汗八里宫廷中争竞无望的少林寺开始回过头来，设法重新争取百废待兴的中国武术世界。持消极保守态度的方丈天鸣去世后，主张倒向蒙古方面的无相禅师倒台，支持汉人抵抗运动的无色禅师得以掌握大权，此人曾参与杨过领导下的汉人游击战争，在襄阳会战中对蒙古军团进行过大胆的军事突袭。136

在13世纪50年代，埋没多年的高级武术教程《九阳真经》（Canonicus Verus Enneadi）被意外地发现了。一位籍籍无名的少林僧侣觉远和他的弟子张君宝学习了这部经典武术，在1262年无色也从觉远那里获悉了其中的部分内容。无色在吸收《九阳真经》的基础上，创造了“少林九阳功”的高超武术——少林派得以复兴也部分仰仗于此。在13世纪80年代，无色禅师成为少林的新一任方丈，并领导少林走向了武林中的领袖地位——在这个时期的武术世界版图中，已经没有力量能够与之竞争。

到了14世纪初，少林寺再度在武术世界受到旧时代的尊敬，并蒸蒸日上。但是很快，少林发现了一个足以和自己并驾齐驱的对手，此人恰恰是它自身培养出来的掘墓人。

觉远的学生张君宝（1247年—？）在少林寺跟随老师秘密修习《九阳真经》，从而使自己的格斗能力远远跃居同辈人之上。1262年，他在一次武术交流活动中意外地令昆仑派武术大师何足道铩羽而归，而后者令少林派中最杰出的武术家也感到畏惧。137张君宝过分优异的表现令少林上层感到不快，他们审核了张君宝学习武术的资格，发现张君宝事实上